MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natronobacterium gregoryi SP2 chromosome

Total Repeats: 80831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019792	ACG	2	6	380	385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190046
2	NC_019792	ACG	2	6	407	412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190046
3	NC_019792	CGA	2	6	426	431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190046
4	NC_019792	TCG	2	6	473	478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190046
5	NC_019792	GAGC	2	8	534	541	25 %	0 %	50 %	25 %	429190046
6	NC_019792	ACC	2	6	545	550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429190046
7	NC_019792	TCGG	2	8	594	601	0 %	25 %	50 %	25 %	429190046
8	NC_019792	ACG	2	6	632	637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190046
9	NC_019792	ATC	2	6	694	699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190046
10	NC_019792	GCG	2	6	737	742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190046
11	NC_019792	ACT	2	6	776	781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190046
12	NC_019792	CGA	2	6	837	842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190046
13	NC_019792	GAC	2	6	859	864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190046
14	NC_019792	ACC	2	6	962	967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429190046
15	NC_019792	TC	3	6	990	995	0 %	50 %	0 %	50 %	429190046
16	NC_019792	ACG	2	6	1022	1027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190046
17	NC_019792	CGC	2	6	1057	1062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190046
18	NC_019792	GAC	2	6	1090	1095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190046
19	NC_019792	CGG	2	6	1109	1114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190046
20	NC_019792	CGAT	2	8	1151	1158	25 %	25 %	25 %	25 %	429190046
21	NC_019792	TCC	2	6	1160	1165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429190046
22	NC_019792	AAG	2	6	1186	1191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190046
23	NC_019792	ACG	3	9	1196	1204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190046
24	NC_019792	CAG	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190046
25	NC_019792	CGA	2	6	1352	1357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190046
26	NC_019792	ATC	2	6	1360	1365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190046
27	NC_019792	CT	3	6	1411	1416	0 %	50 %	0 %	50 %	429190046
28	NC_019792	CGCGGT	2	12	1492	1503	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	429190046
29	NC_019792	ACT	2	6	1521	1526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190046
30	NC_019792	AAG	2	6	1546	1551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190046
31	NC_019792	GAG	2	6	1585	1590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429190046
32	NC_019792	GACC	2	8	1675	1682	25 %	0 %	25 %	50 %	429190047
33	NC_019792	TCG	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190047
34	NC_019792	CGACGC	2	12	1783	1794	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	429190047
35	NC_019792	GTC	2	6	1854	1859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190047
36	NC_019792	TCG	2	6	1916	1921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190048
37	NC_019792	ACG	2	6	1970	1975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
38	NC_019792	GAC	2	6	2014	2019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
39	NC_019792	TCG	2	6	2063	2068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190048
40	NC_019792	CGA	2	6	2094	2099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
41	NC_019792	CCG	2	6	2105	2110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190048
42	NC_019792	TGA	2	6	2247	2252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190048
43	NC_019792	TCG	2	6	2307	2312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190048
44	NC_019792	GAG	2	6	2335	2340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429190048
45	NC_019792	CGC	2	6	2352	2357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190048
46	NC_019792	GAT	2	6	2383	2388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190048
47	NC_019792	GAA	2	6	2413	2418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190048
48	NC_019792	CCG	2	6	2444	2449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190048
49	NC_019792	CGG	2	6	2526	2531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190048
50	NC_019792	GAC	2	6	2542	2547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
51	NC_019792	CGC	2	6	2560	2565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190048
52	NC_019792	CGA	2	6	2598	2603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
53	NC_019792	CGA	2	6	2622	2627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
54	NC_019792	CGG	2	6	2688	2693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190048
55	NC_019792	TGC	2	6	2754	2759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190048
56	NC_019792	CGA	2	6	2763	2768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
57	NC_019792	GCG	2	6	2792	2797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190048
58	NC_019792	TCGCG	2	10	2815	2824	0 %	20 %	40 %	40 %	429190048
59	NC_019792	ACG	2	6	2825	2830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
60	NC_019792	TCG	2	6	2868	2873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190048
61	NC_019792	GCA	2	6	2924	2929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
62	NC_019792	CTG	2	6	2964	2969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190048
63	NC_019792	AGC	2	6	3029	3034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
64	NC_019792	GAAC	2	8	3042	3049	50 %	0 %	25 %	25 %	429190048
65	NC_019792	CGA	2	6	3111	3116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
66	NC_019792	GCC	2	6	3118	3123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190048
67	NC_019792	CGA	2	6	3165	3170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
68	NC_019792	GAA	2	6	3244	3249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190048
69	NC_019792	CGA	2	6	3255	3260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190048
70	NC_019792	ATA	2	6	3338	3343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429190048
71	NC_019792	CCG	2	6	3377	3382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190048
72	NC_019792	GTC	2	6	3409	3414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190048
73	NC_019792	TCG	2	6	3434	3439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190048
74	NC_019792	CCAC	2	8	3873	3880	25 %	0 %	0 %	75 %	429190049
75	NC_019792	GAG	2	6	3910	3915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429190049
76	NC_019792	GT	3	6	3932	3937	0 %	50 %	50 %	0 %	429190049
77	NC_019792	ACG	2	6	3938	3943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190049
78	NC_019792	CGA	2	6	3969	3974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190049
79	NC_019792	TCG	2	6	4001	4006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190049
80	NC_019792	TCGA	2	8	4123	4130	25 %	25 %	25 %	25 %	429190049
81	NC_019792	CGA	2	6	4152	4157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190049
82	NC_019792	GAG	2	6	4231	4236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429190049
83	NC_019792	ACG	2	6	4238	4243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190049
84	NC_019792	CCG	2	6	4267	4272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190049
85	NC_019792	ACG	2	6	4314	4319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190049
86	NC_019792	TCG	2	6	4406	4411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190049
87	NC_019792	CGG	2	6	4422	4427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190049
88	NC_019792	GAC	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190049
89	NC_019792	GAA	2	6	4527	4532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190049
90	NC_019792	GGC	2	6	4587	4592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190049
91	NC_019792	CGCGG	2	10	4612	4621	0 %	0 %	60 %	40 %	429190049
92	NC_019792	CGT	2	6	4623	4628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190049
93	NC_019792	CG	3	6	4652	4657	0 %	0 %	50 %	50 %	429190049
94	NC_019792	CGC	2	6	4659	4664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190049
95	NC_019792	ACT	2	6	4741	4746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190049
96	NC_019792	GAA	2	6	4768	4773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190049
97	NC_019792	TCGA	2	8	4792	4799	25 %	25 %	25 %	25 %	429190049
98	NC_019792	GCC	3	9	4867	4875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190049
99	NC_019792	AC	3	6	4891	4896	50 %	0 %	0 %	50 %	429190049
100	NC_019792	GAA	2	6	4999	5004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190049
101	NC_019792	TAC	2	6	5015	5020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190049
102	NC_019792	CGA	2	6	5236	5241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190050
103	NC_019792	ACGA	2	8	5298	5305	50 %	0 %	25 %	25 %	429190050
104	NC_019792	GTTC	2	8	5334	5341	0 %	50 %	25 %	25 %	429190050
105	NC_019792	TCG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190050
106	NC_019792	CGT	3	9	5377	5385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190050
107	NC_019792	CGCTGG	2	12	5386	5397	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	429190050
108	NC_019792	CTCG	2	8	5401	5408	0 %	25 %	25 %	50 %	429190050
109	NC_019792	GC	3	6	5428	5433	0 %	0 %	50 %	50 %	429190050
110	NC_019792	GA	3	6	5484	5489	50 %	0 %	50 %	0 %	429190050
111	NC_019792	ACG	2	6	5490	5495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190050
112	NC_019792	GTC	2	6	5618	5623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190050
113	NC_019792	CGA	2	6	5635	5640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190050
114	NC_019792	TCC	2	6	5646	5651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429190050
115	NC_019792	GCAG	2	8	5659	5666	25 %	0 %	50 %	25 %	429190050
116	NC_019792	GGC	2	6	5716	5721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190050
117	NC_019792	ATC	2	6	5733	5738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190050
118	NC_019792	TCG	2	6	5760	5765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190050
119	NC_019792	CGA	2	6	5776	5781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190050
120	NC_019792	GGAC	2	8	5878	5885	25 %	0 %	50 %	25 %	429190050
121	NC_019792	CGCT	2	8	5906	5913	0 %	25 %	25 %	50 %	429190050
122	NC_019792	GAG	2	6	5924	5929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429190050
123	NC_019792	CGA	2	6	5953	5958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190051
124	NC_019792	GGAC	2	8	5975	5982	25 %	0 %	50 %	25 %	429190051
125	NC_019792	CGT	2	6	5989	5994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190051
126	NC_019792	TCGA	2	8	6000	6007	25 %	25 %	25 %	25 %	429190051
127	NC_019792	CTC	2	6	6026	6031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429190051
128	NC_019792	GTC	2	6	6036	6041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190051
129	NC_019792	CGT	2	6	6043	6048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190051
130	NC_019792	TCG	2	6	6085	6090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190051
131	NC_019792	TCG	2	6	6398	6403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190052
132	NC_019792	GGT	2	6	6417	6422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429190052
133	NC_019792	GTC	2	6	6450	6455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190052
134	NC_019792	TTC	2	6	6486	6491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429190052
135	NC_019792	CGTCG	2	10	6522	6531	0 %	20 %	40 %	40 %	429190052
136	NC_019792	TCG	2	6	6538	6543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190052
137	NC_019792	CGC	2	6	6572	6577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190052
138	NC_019792	GCG	2	6	6589	6594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190052
139	NC_019792	CTT	3	9	6605	6613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429190052
140	NC_019792	GTA	2	6	6642	6647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190052
141	NC_019792	CGT	2	6	6752	6757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190052
142	NC_019792	TCG	2	6	6786	6791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190052
143	NC_019792	CTC	2	6	6807	6812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429190052
144	NC_019792	GAT	2	6	6831	6836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190052
145	NC_019792	CGGC	2	8	6859	6866	0 %	0 %	50 %	50 %	429190052
146	NC_019792	GCG	2	6	6895	6900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190052
147	NC_019792	TGG	2	6	6921	6926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429190052
148	NC_019792	CGT	2	6	6968	6973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190052
149	NC_019792	GAT	2	6	7005	7010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190052
150	NC_019792	CCG	2	6	7029	7034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190052
151	NC_019792	CAG	2	6	7152	7157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190052
152	NC_019792	GTCTCG	2	12	7207	7218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190052
153	NC_019792	TTC	2	6	7293	7298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429190052
154	NC_019792	CGA	2	6	7316	7321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190052
155	NC_019792	TGC	2	6	7341	7346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190052
156	NC_019792	CCA	2	6	7494	7499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429190053
157	NC_019792	ACG	2	6	7510	7515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190053
158	NC_019792	CGG	2	6	7549	7554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190053
159	NC_019792	CCT	2	6	7576	7581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429190053
160	NC_019792	TCG	2	6	7641	7646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190053
161	NC_019792	CGC	2	6	7666	7671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190053
162	NC_019792	ACC	2	6	7764	7769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429190053
163	NC_019792	TCG	2	6	7866	7871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190053
164	NC_019792	TCG	2	6	7881	7886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190053
165	NC_019792	ACG	2	6	7891	7896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190053
166	NC_019792	CCG	2	6	7905	7910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190053
167	NC_019792	TCG	2	6	7914	7919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190053
168	NC_019792	GCGT	2	8	7928	7935	0 %	25 %	50 %	25 %	429190053
169	NC_019792	TCG	2	6	7942	7947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190053
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171	NC_019792	CGA	2	6	7987	7992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190053
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174	NC_019792	CGG	2	6	8029	8034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429190053
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180	NC_019792	GAAC	2	8	8168	8175	50 %	0 %	25 %	25 %	429190053
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209	NC_019792	CAG	2	6	9606	9611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190054
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223	NC_019792	CGAC	3	12	10262	10273	25 %	0 %	25 %	50 %	429190054
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225	NC_019792	GAT	2	6	10341	10346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190054
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227	NC_019792	CGA	2	6	10451	10456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190054
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233	NC_019792	ACG	2	6	10920	10925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190055
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237	NC_019792	TCG	2	6	11254	11259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190055
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239	NC_019792	GCT	3	9	11297	11305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190055
240	NC_019792	TTC	2	6	11388	11393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429190055
241	NC_019792	CGA	2	6	11455	11460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190055
242	NC_019792	TCC	2	6	11503	11508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429190055
243	NC_019792	CGA	2	6	11525	11530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190055
244	NC_019792	CGA	2	6	11584	11589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190055
245	NC_019792	CGT	2	6	11618	11623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190055
246	NC_019792	GTC	2	6	11643	11648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190055
247	NC_019792	TCC	2	6	11686	11691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429190055
248	NC_019792	CGAC	2	8	11881	11888	25 %	0 %	25 %	50 %	429190056
249	NC_019792	G	6	6	12028	12033	0 %	0 %	100 %	0 %	429190056
250	NC_019792	CGC	2	6	12059	12064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190056
251	NC_019792	ACG	2	6	12070	12075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190056
252	NC_019792	CG	3	6	12113	12118	0 %	0 %	50 %	50 %	429190056
253	NC_019792	GCA	2	6	12141	12146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190056
254	NC_019792	GAC	2	6	12173	12178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190056
255	NC_019792	AC	3	6	12177	12182	50 %	0 %	0 %	50 %	429190056
256	NC_019792	TCC	2	6	12190	12195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429190056
257	NC_019792	GATC	2	8	12205	12212	25 %	25 %	25 %	25 %	429190056
258	NC_019792	ACT	2	6	12232	12237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190056
259	NC_019792	GAA	2	6	12257	12262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190056
260	NC_019792	GA	3	6	12274	12279	50 %	0 %	50 %	0 %	429190056
261	NC_019792	GAT	2	6	12309	12314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429190056
262	NC_019792	GCC	2	6	12318	12323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190056
263	NC_019792	CGA	2	6	12365	12370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190056
264	NC_019792	CGC	2	6	12382	12387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190056
265	NC_019792	CAG	2	6	12399	12404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190056
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267	NC_019792	ACG	2	6	12454	12459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429190056
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289	NC_019792	GCC	2	6	13446	13451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429190057
290	NC_019792	G	6	6	13516	13521	0 %	0 %	100 %	0 %	429190057
291	NC_019792	TCA	2	6	13522	13527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429190057
292	NC_019792	TCG	2	6	13531	13536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190057
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295	NC_019792	TACGC	2	10	13700	13709	20 %	20 %	20 %	40 %	429190057
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297	NC_019792	TCTGGC	2	12	13805	13816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429190058
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381	NC_019792	AAG	2	6	17363	17368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429190060
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383	NC_019792	CGAA	2	8	17448	17455	50 %	0 %	25 %	25 %	429190060
384	NC_019792	AC	3	6	17516	17521	50 %	0 %	0 %	50 %	429190060
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